wc_sim documentation

Whole-cell model simulator

Contents

• 1. Installation
  • 1.1. Prerequisites
  • 1.2. Latest revision from GitHub
• 2. API documentation
  • 2.1. wc_sim package
    • 2.1.1. Subpackages
    • 2.1.2. Submodules
    • 2.1.3. wc_sim.__main__ module
    • 2.1.4. wc_sim._version module
    • 2.1.5. wc_sim.aggregate_distributed_props module
    • 2.1.6. wc_sim.debug_logs module
    • 2.1.7. wc_sim.distributed_properties module
    • 2.1.8. wc_sim.dynamic_components module
    • 2.1.9. wc_sim.future_multialgorithm_simulation module
    • 2.1.10. wc_sim.message_types module
    • 2.1.11. wc_sim.metadata module
    • 2.1.12. wc_sim.model_utilities module
    • 2.1.13. wc_sim.multialgorithm_checkpointing module
    • 2.1.14. wc_sim.multialgorithm_errors module
    • 2.1.15. wc_sim.multialgorithm_simulation module
    • 2.1.16. wc_sim.run_results module
    • 2.1.17. wc_sim.sim_config module
    • 2.1.18. wc_sim.simulation module
    • 2.1.19. wc_sim.species_populations module
    • 2.1.20. Module contents
• 3. About
  • 3.1. License
  • 3.2. Development team
  • 3.3. Acknowledgements
  • 3.4. Questions and comments
• 4. References