4. datanator

• 4.1. datanator package
  • 4.1.1. Subpackages
    • 4.1.1.1. datanator.config package
      • 4.1.1.1.1. Submodules
      • 4.1.1.1.2. datanator.config.core module
      • 4.1.1.1.3. Module contents
    • 4.1.1.2. datanator.core package
      • 4.1.1.2.1. Submodules
      • 4.1.1.2.2. datanator.core.data_model module
      • 4.1.1.2.3. datanator.core.data_source module
      • 4.1.1.2.4. Module contents
    • 4.1.1.3. datanator.data_source package
      • 4.1.1.3.1. Subpackages
      • 4.1.1.3.2. Submodules
      • 4.1.1.3.3. datanator.data_source.corum_nosql module
      • 4.1.1.3.4. datanator.data_source.ec module
      • 4.1.1.3.5. datanator.data_source.gene_ortholog module
      • 4.1.1.3.6. datanator.data_source.intact_nosql module
      • 4.1.1.3.7. datanator.data_source.kegg_org_code module
      • 4.1.1.3.8. datanator.data_source.kegg_orthology module
      • 4.1.1.3.9. datanator.data_source.kegg_reaction_class module
      • 4.1.1.3.10. datanator.data_source.metabolite_nosql module
      • 4.1.1.3.11. datanator.data_source.metabolites_meta_collection module
      • 4.1.1.3.12. datanator.data_source.modomics module
      • 4.1.1.3.13. datanator.data_source.pax_nosql module
      • 4.1.1.3.14. datanator.data_source.protein_aggregate module
      • 4.1.1.3.15. datanator.data_source.sabio_compound module
      • 4.1.1.3.16. datanator.data_source.sabio_reaction module
      • 4.1.1.3.17. datanator.data_source.sabio_rk module
      • 4.1.1.3.18. datanator.data_source.sabio_rk_json_mongo module
      • 4.1.1.3.19. datanator.data_source.sabio_rk_nosql module
      • 4.1.1.3.20. datanator.data_source.sqlite_to_json module
      • 4.1.1.3.21. datanator.data_source.taxon_tree module
      • 4.1.1.3.22. datanator.data_source.uniprot_nosql module
      • 4.1.1.3.23. Module contents
    • 4.1.1.4. datanator.schema_2 package
      • 4.1.1.4.1. Submodules
      • 4.1.1.4.2. datanator.schema_2.migrate_corum module
      • 4.1.1.4.3. datanator.schema_2.migrate_ec module
      • 4.1.1.4.4. datanator.schema_2.migrate_metabolite_concentration module
      • 4.1.1.4.5. datanator.schema_2.migrate_metabolites_meta module
      • 4.1.1.4.6. datanator.schema_2.migrate_taxon_tree module
      • 4.1.1.4.7. datanator.schema_2.migrate_uniprot module
      • 4.1.1.4.8. datanator.schema_2.transform module
      • 4.1.1.4.9. datanator.schema_2.transform_metabolite_concentrations module
      • 4.1.1.4.10. datanator.schema_2.transform_metabolites_meta module
      • 4.1.1.4.11. Module contents
    • 4.1.1.5. datanator.util package
      • 4.1.1.5.1. Submodules
      • 4.1.1.5.2. datanator.util.base26 module
      • 4.1.1.5.3. datanator.util.build_util module
      • 4.1.1.5.4. datanator.util.calc_tanimoto module
      • 4.1.1.5.5. datanator.util.chem_util module
      • 4.1.1.5.6. datanator.util.constants module
      • 4.1.1.5.7. datanator.util.file_util module
      • 4.1.1.5.8. datanator.util.index_collection module
      • 4.1.1.5.9. datanator.util.molecule_util module
      • 4.1.1.5.10. datanator.util.mongo_util module
      • 4.1.1.5.11. datanator.util.reaction_util module
      • 4.1.1.5.12. datanator.util.rna_halflife_util module
      • 4.1.1.5.13. datanator.util.rna_seq_util module
      • 4.1.1.5.14. datanator.util.taxonomy_util module
      • 4.1.1.5.15. datanator.util.warning_util module
      • 4.1.1.5.16. Module contents
  • 4.1.2. Submodules
  • 4.1.3. datanator.__main__ module
  • 4.1.4. datanator._version module
  • 4.1.5. datanator.parse_metabolite_concentration module
  • 4.1.6. Module contents